Геральдическое описание герба: "В золотом поле черная лисица с серебряным концом хвоста. В левой вольной части герб Вологодской области."
Символика герба. За основу герба Тотемского муниципального района взят исторический герб города Тотьмы, утвержденный 2 октября 1780 г. Подлинное описание которого гласит: "В первой части щита герб Вологодской области. Во второй части щита черная лисица, в золотом поле - в знак того, что жители этого города в ловле тех зверей упражняются".
Фигура американской черной лисы как символ выдающейся роли тотемских купцов и мореходов, их заслуг в освоении островов Тихого океана и побережья Северной Америки в 18-19 веках.
Черный цвет указывает не только на историческую аналогию, но означает личную сдержанность, высокую образованность.
Золотой фон герба означает богатство, верность, чистоту, как признание значимости Тотьмы в различные периоды российской истории.
Золото - символ прочности, величия, интеллекта, великодушия.
Герб Вологодской области, помещенный в вольной части (в верхнем левом углу) указывает на территориальную принадлежность к Вологодской области.
Описание флага: "Флаг Тотемского района представляет собой желтое полотнище с отношением ширине к длине 2:3, несущее изображение фигур герба района с алой полосой вдоль верхней стороны в ¼ флага".
Символика флага. За основу флага Тотемского муниципального района взят современный герб Тотемского муниципального района, разработанный на основании исторического герба города Тотьмы. Желтый фон флага означает богатство, верность, чистоту, как признание значимости Тотьмы в различные периоды российской истории. Желтый (Золотой) - символ прочности, величия, интеллекта, великодушия. Алая полоса по краю флага показывает то, что Тотемский муниципальный район расположен в Вологодской области, основной цвет символики красный.